2021年6月1日零时至6月30日24时，全省报告法定甲乙丙类传染病发病13286例，死亡11例。甲类传染病鼠疫和霍乱无病例报告。
乙类传染病中传染性非典型肺炎、脊髓灰质炎、人感染高致病性禽流感、出血热、狂犬病、乙脑、登革热、炭疽、白喉、新生儿破伤风、钩体病、血吸虫病、人感染H7N9禽流感、新型冠状病毒肺炎14种传染病无病例报告,其余13种乙类传染病的报告病例总数为7946例，报告死亡11例（均为艾滋病）。报告发病数居前五位的病种为：乙肝、梅毒、肺结核、丙肝、布病，占乙类传染病报告发病数的89.33%。
丙类传染病中麻风病、包虫病和丝虫病无病例报告，其余8种丙类传染病的报告病例总数为5340例，报告发病数居前三位的病种为：其它感染性腹泻病、手足口病、流行性感冒，占丙类传染病报告发病数的95.19%，无死亡病例。
2021年7月卫生健康提示：近期，云南省出现了本土新冠肺炎疫情，“外防输入、内防反弹”的疫情防控形势依然严峻复杂，建议公众积极接种新冠肺炎疫苗，密切关注国内疫情动态，坚持科学佩戴口罩、勤洗手、常通风、不聚集。7月高温多雨，蚊虫繁殖加快，公众应采取防暑防蚊措施，防止高温中暑和虫媒传染病的发生。注意饮食卫生，饭前便后洗手，食物加工时生熟食分开，防止肠道传染病和食物中毒的发生。
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